第1部分第2部分
辨症玉函
伤寒直格方
神农尝百草论亢则害承乃制论四气所伤论张仲景伤寒立法考伤寒温病热病说伤寒三阴病或寒或热辨阳虚阴盛阳盛阴虚论伤寒三百九十七法辨伤寒四逆厥辨呕吐干呕哕咳逆辨中风辨中暑中热辨积热沉寒论泻南方补北方论五郁论二阳
许氏医案
凡例八则卷一总论脉学源流定脉部位尺寸解六部脉解左心膻中肝胆肾小肠、右肺胸中脾胃命大肠·辨定至数二十七脉名目有胃气者生脉贵有神读缓字法四时平脉浮、沉、迟、数四大纲浮沉迟数对待总论微与细对微细虚与实对虚实
前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
序卷第一述增损旧方用药犯禁决述旧方合药法述看方及逆合备急药决治胸痹诸方治胸胁痰冷气满诸方治心痛腹胀满冷痛诸方治下利诸方治咳嗽上气诸气治气逆如奔豚状并诸汤方治虚满水肿诸方卷第二治头面风（论杂风状）诸方治
序自序辨病源第一辨经络第二辨色第三辨脉第四辨手太阴本病症治第五辨手少阳标病第六辨手少阴标病第七辨三经标本并病第八辨救误上第九辨救误下第十辨善后第十一辨外治第十二辨禁忌第十三辨张氏无治之症第十四辨耐修药